Q.

共有フォルダに追加したユーザーが、フォルダ内のシェアノートに参加できません。

共有フォルダに新たに追加したユーザーが、フォルダ内の配布済みのシェアノートを開くと「シェアノートに参加する権限がありません」と出る場合は、シェアノートごとに参加する権限を追加する必要があります。
権限の追加はシェアノートのオーナー(または進行係)が行います。